长期喝酵素的危害危害有以下几种：1、由于酵素中的含糖量较高，如果空腹血糖受损的患者或是患有糖尿病的患者是不建议长期使用的，会导致血糖的异常升高。2、制作酵素的发酵温度和适合细菌的滋生，所以如果自己制作酵素，并且环境条件较差，会产生有毒的物质或是导致细菌滋生，如果长期的喝酵素对导致内分泌紊乱和机体抵抗力下降。酵素需要在医生指导下合理使用，减肥最好结合饮食控制和运动疗法。