手足口疫苗的不良反应是部分人在接种以后发现接种部位发红、发硬、疼痛、肿胀、瘙痒，这是局部反应，如果没有不适一般三天左右自动缓解。也有人在接种之后发热，多数是轻度发热，体温不会超过38℃，持续时间一到两天。部分接种者还有恶心、呕吐、头晕、食欲不振、浑身无力、流泪、鼻塞或流鼻涕等表现。手足口疫苗接种成功能预防EV71型感染导致的手足口病，注射后如果出现严重不适及时就医。