甲状腺结节与囊肿哪个更严重并不好说，因为甲状腺结节分为良性及恶性等两种，而囊肿大多数都是良性的，若是甲状腺结节是恶性的，那么相对而言就会更加严重点，但若两种都是良性的就不好比较了，因为对身体健康都不会造成很大的影响，而且也可以不需要特殊治疗，平时定期随访就好。若是甲状腺结节或囊肿出现明显症状，或者是属于恶性的，那么就建议入院进行手术治疗了。