盐酸林可霉素滴眼液的主要成分是盐酸林可霉素，对此成分过敏的人群禁止使用此药物，以免用药后出现过敏反应，表现为皮疹以及眼部瘙痒等。一个月以内的婴儿也禁用此药物，孕妇以及哺乳期的女性应慎用此药物。其次盐酸林可霉素滴眼液也不宜过量使用，过量使用后可能会出现中性粒细胞减少、血小板减低以及念珠菌感染等不良反应，此药物也不宜和新生霉素、卡那霉素联合使用。