引起肚脐眼上疼痛的原因有：一、在吃了具有刺激性、不卫生的食物，或者感冒受凉后导致胃肠道痉挛。二、如果肚脐眼上面疼还伴有反酸、恶心、呕吐的症状时，可能是胃肠道疾病导致。如果疼痛在进食后缓解，考虑是十二指肠溃疡。如果是进食后疼痛，考虑是胃溃疡。三、肝炎、胆囊炎、胆结石、肾结石、急性腹膜炎、急性阑尾炎、肠系膜淋巴炎、胰腺炎等。导致肚脐上的疼痛原因有很多，需要根据不同的疼痛特点进行辨别。建议去医院进行腹部检查，明确病因后对症治疗。