肠结核做肠镜可以检查出来。肠结核可以通过进行肠镜检查发现肠结核患者的肠黏膜比较狭窄或者肠黏膜出现充血、溃疡以及水肿等异常表现。肠镜检查过程中，若是发现患者出现异常，可以直接取出活检组织，对该组织进行化验，若是化验结果显示存在结核分枝杆菌则可以直接对疾病进行诊断。此外，肠结核也可以通过进行粪便检查、CT检查以及X线检查来进行综合判断。