头疼做ct还是做磁共振不能一概而论，如果头疼是由于肿瘤或者急性脑梗塞引起的，一般建议进行头部核磁共振检查，如果头疼是由于缺血性脑血管疾病或者颅骨外伤骨折引起的，则建议进行头部CT检查。头部CT和头部核磁共振检查，各有各的好处，建议患者听从医嘱进行检查。医生会根据所有的检查结果对病情进行综合判断，给出治疗方案。头疼的患者平时应多休息，避免过度劳累。