精子头部缺陷大多由于畸形精子症引起，这种情况需要通过对症治疗来缓解。如果是急性睾丸炎引起，可以使用氨基糖苷类抗生素以及头孢菌素类药物进行治疗。如果局部出现睾丸肿胀的症状，还应入院进行手术治疗，恢复睾丸部位的血液循环。如果是精囊炎引起，急性精囊炎以抗生素治疗为主，患者出现精囊结核的时候应入院进行抗结核治疗，临床上以异烟肼、利福平药物治疗为主。