手上起小水泡的治疗应根据患者的病情对症选择合适的治疗方法，如果手上起小水泡是因为过敏或者湿疹导致的，则可以选择一些抗组胺的药物进行治疗，常用的是氯雷他定等。如果患者手上起小水泡是因为真菌感染导致的，则可以选择一些抗真菌的药物进行治疗，常用的是盐酸特比萘芬。如果是病毒感染导致的水泡，则患者应选择一些抗病毒的药物进行治疗，常用的是阿昔洛韦等。建议患者平时应多注意个人卫生，避免挠抓患处。