怀孕六周是可以做药流的，药物流产一般适合怀孕49天内的女性，理论上怀孕六周没有超过49天，可以先去医院做B超检查胎儿的大小，只要胎儿发育的正常，不是属于体型特别大的胎儿，可以选择进行药物流产。但是做完药物流产之后，有可能会出现流产不全的现象。一般是建议在做完流产一周后，去医院做B超的复查，如果发现流产不全，需要及时进行清宫治疗，防止对身体造成损伤。