临床上对于腋窝黑色素沉淀的治疗，首先需要患者明确具体引起的原因，之后再针对病因进行治疗，例如多见于黑棘皮病引起的腋窝黑色素沉淀，患者可以前往正规的美容机构，进行激光去除治疗；若是由于腋窝炎症之后留下的黑色素沉淀，可以在医生的指导下应用抗炎药物进行治疗；而对于肾上腺皮质功能减退造成的，需要及时补充肾上腺皮质激素，这样才能使黑色素沉淀逐渐好转。