奥美拉唑的副作用主要有1.消化系统的症状主要有口干、腹胀、便秘、腹泻、恶心、呕吐等，还会导致萎缩性胃炎的发生。2.内分泌系统的症状，长期服用该药物会导致维生素B12缺乏的症状。3.神经系统的症状，患者会出现嗜睡、头晕、失眠、头痛、神经炎等。4.致癌性，长期服用会导致-肠嗜铬细胞增生，增加患癌的几率。5.其他系统的症状，部分人服用药物后可能会出现溶血、乳房发育、过敏、皮疹等不适的症状。