心理咨询师证书的种类有很多，如：中国科学院心理研究所(中科院心理所),中国国家人事人才培训网(国培网),中国心理学会(中国心理学会标准与服务研究委员会，简称标准委),中国心理卫生协会(中心协)等等。

不同的机构颁发的证书有不同的认证方式和考试内容，因此需要根据自己的需求选择合适的证书，国家三级心理咨询师、国家二级心理咨询师是职业资格认证，发证单位为人力资源和社会保障部职业技能鉴定中心；而心理咨询师基础培训合格证书则是培训合格证书，发证单位为中国科学院心理研究所。