头骨凹陷的原因有：头部受到外伤，会引起局部头皮出现肿胀凸起，在肿胀头皮旁边就会出现相应的凹陷。如果外伤导致颅骨骨折，造成颅骨凹陷性骨折，就会出现头骨凹陷。还可能是头骨血管损伤，造成萎缩，而出现头骨凹陷。此外还可能是颅内的肿瘤侵犯颅骨，而出现这一现象。建议及时去医院就诊，确诊病因后对症治疗。如果存在颅骨骨折或者是颅内肿瘤，可能需要进行手术治疗。