可导致长时间腹泻的原因复杂多样，其中较为常见的可有肠胃感染及肠胃功能紊乱。若患者近期饮食不洁或曾密切接触同类患者，则可直接形成感染，因病原微生物持续繁殖及产生毒素，故肠道可受刺激导致蠕动加快、肠液分泌增多，形成持续腹泻。此外，如患者自身患有肠息肉、肠癌或进食较多的辛辣刺激、生冷油腻食物，则也可应肠胃损伤及应激产生功能紊乱，故也可能形成长期腹泻。