早上起来腰两边酸疼考虑是腰椎间盘突出症引起的，增生的腰椎压迫周围的肌肉、血管、神经等组织，会产生疼痛不适的症状。还考虑是由于睡觉时床垫较软，影响腰部的正常形态，腰部的肌肉张力增加引起的疼痛症状。其次考虑是肾脏疾病引起的症状，如肾积水、肾结石等，也会引起腰部疼痛不适的症状。如果症状持续不能好转的患者需要及时去医院进行腰部CT检查明确病因。