肛门有肉疙瘩需要根据病因对症治疗。若是因为痔疮而引起的肉疙瘩，需要局部涂抹润滑、收敛的药物并配合高锰酸钾溶液坐浴进行治疗；保守治疗效果差的可以进行手术切除赘生物。若是因为肛乳头瘤而引起的肉疙瘩，则可以使用冷冻、电灼、激光的物理方法切除，或是进行吻合器痔上黏膜环切术切除。患者平时需注意个人卫生，定时清洗肛门周围皮肤，避免用手用力抓挠肛门处的肉疙瘩。