卵巢囊肿需要分为生理学与病理性两种，生理学囊肿多是滤泡囊肿或是黄体囊肿。黄体囊肿的形成与卵巢排卵有关系，生理性囊肿会自动消失，不需要采取特殊的治疗措施。病理性卵巢囊肿多没有明确的病因，若是患者出现的是巧克力囊肿，需要考虑与子宫内膜异位症有关系，若是患者的囊肿是畸胎瘤，需要考虑是胚胎时期生殖细胞发育异常导致的。多数的病理性卵巢囊肿病因并不明确。