小孩疱疹性咽峡炎可以在医生的指导下用干扰素、利巴韦林等抗病毒的药物治疗。患者体温超过三十八度五的时候，还要用退烧的药物治疗，比如布洛芬或对乙酰氨基酚。另外可以通过温水擦浴、冰敷、酒精擦浴等物理降温的方式帮患者降低体温。这段时间最好让患者进行隔离治疗，饮食方面可以给孩子吃小米粥或大米粥等清淡易消化的食物。要避免给患者吃辣椒或花椒等辛辣的食物。