射精后小腹疼痛有可能是精囊炎、前列腺炎、输尿管结石、尿道炎等引起的，患者同房时动作剧烈或性生活过于频繁也会有同样的症状。患者出现精索炎或附睾炎的时候也会有射精后小腹疼痛的表现。建议最好去做前列腺彩超、尿常规等检查，如果是前列腺炎引起的，需要在医生的指导下用左氧氟沙星等消炎的药物治疗。如果是精囊炎导致的症状，则需要遵医嘱用黄连素离子透入治疗改善症状。