黄体功能不足病因目前不明确，可能与黄体生成素、促卵泡成熟素分泌不足、催乳素分泌过多或过少有关，也可能是卵泡不成熟，对性腺激素不敏感造成的，还考虑与雌激素与黄体分泌的孕激素不协调有关。有可能是卵巢早衰、甲状腺功能异常会垂体病变导致上述情况的出现。黄体功能不足平时可导致月经周期缩短、非经期出血，备孕期间可发现难以受孕，怀孕的女性黄体功能不足，会导致流产。