一般情况下激光去扁平疣是会留下疤痕的。扁平疣是一种由于人乳头瘤病毒感染而导致的皮肤疾病，病变部位常突出于皮肤表面，因此临床上一般选用激光治疗的方法。在治疗过程中，激光灼烧可能会破坏患者皮肤真皮层的组织细胞，导致恢复过程中皮肤纤维组织出现排列混乱的情况，进而导致瘢痕的出现。患者可以在扁平疣激光手术后，选择在患处表面涂抹类人胶原蛋白硅凝胶，帮助皮肤纤维组织正常排序，避免留下疤痕；除此之外，也可选择外用重组人干扰素凝胶等方法治疗扁平疣，通常也不会留下疤痕。