消化不良引起发烧时可进行物理降温处理，如温水擦浴、贴退热贴、减少衣物等，同时还可以对小腹做按摩，也可以配合促胃肠动力药和助消化药口服，缓解消化不良症状，减轻发热症状。若是患者发烧明显，体温超过了38.5摄氏度，这时可给予退热药物治疗，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。若是发热持续不退，考虑存在细菌感染情况，可配合抗生素类药物治疗。治疗期间饮食上要注意清淡、易消化，可多吃些香蕉、火龙果、猕猴桃等食物，有助于缓解消化不良症状。