肛门有脉搏跳动的感觉主要是因为肛窦炎导致的。肛窦炎主要是因为以下原因引起的：可能是因为不健康的饮食习惯导致的，比如经常吃一些辛辣刺激类、油炸类的食物；其次可能是因为肛管受到异物刺激导致肛瓣受损引起的；也有可能是因为粪便积存在肛窦内引发细菌感染或者是出现炎症导致的；还有可能是因为一些肛门直肠疾病导致的。出现这种情况需要及时去医院进行相关的检查，明确具体的病因并选择合适的治疗方法进行治疗。