生理期自慰是有可能会影响生育的，因为生理期自慰，可能会导致发生感染，如阴道炎、宫颈炎或者子宫内膜炎等，并且还有可能会导致子宫内膜异位症，这些妇科疾病均有一定几率影响怀孕。如果导致子宫内膜异位症，会出现痛经、月经异常以及性交痛等症状，通常可以应用非甾体类抗炎药、口服避孕药以及孕激素等进行治疗。建议不要在生理期有自慰以及同房行为，经期注意休息，保持个人卫生、清洁。