儿童做核磁共振的危害非常小。核磁共振是一种临床上非常常用的辅助检查手段，只要检查的次数不过于频繁，几乎不会对人体造成任何的辐射，因此相对而言是比较安全的，家长不必过于担心。但是核磁共振有可能会对儿童造成一定的恐惧心理，因此家长要做好儿童的安抚工作，消除孩子紧张恐惧的心理，让儿童积极的配合检查。如果核磁共振的检查结果提示出某些病变，家长应该尽早采取相应的治疗措施。