患有亚急性甲状腺炎首先要针对甲状腺功能异常的现象进行治疗。症状比较轻微的情况下，可以服用吲哚美辛、阿司匹林、布洛芬等非甾体抗炎药来缓解疼痛。如果是病毒感染引起的亚急性甲状腺炎，需要配合使用利巴韦林等药物进行抗病毒治疗。病情比较严重的情况下，还需要使用强的松、泼尼松等糖皮质激素类药物进行治疗。治疗期间要定期检测血沉，血沉恢复正常后需要减量使用糖皮质激素，总疗程大约在4-8周左右。