睡觉起来头疼的原因首先考虑是睡眠姿势不当，导致颈部肌肉出现痉挛紧张、关节错位，对颈部神经产生压迫引起的；或者是睡姿不当影响椎动脉供血不足，血管狭窄等引起的；如果患有高脂血症、高血压、血小板增多症的患者，在睡觉的时候由于血液粘稠度严重增高，血液流速减慢，也会引起睡觉起来头疼；如果在睡觉的时候没有盖好被子，导致机体受凉引起感冒等，也会出现睡觉起来头疼的情况。