1、病因不同，宫颈囊肿是宫颈腺管堵塞导致腺液排出不畅引起的，宫颈息肉是慢性炎症刺激，导致宫颈管粘膜局部增生引起的。2、临床表现不同，宫颈囊肿一般出现在子宫颈的表面，呈青白色，小而分散，有时会出现糜烂。宫颈息肉一般出现在颈管内和宫颈外口，质地软而脆，容易出血。3、治疗方法不同，宫颈囊肿一般不需要特殊处理，经过一段时间后，会好转和消失，要定期去医院做宫颈癌筛查。宫颈息肉可能会发生恶变，需要做病理检查，然后及时进行手术切除。