慢性结肠炎的治疗方法主要有药物治疗和手术治疗，此病能否根除主要看疾病的种类，炎症性肠病难以治愈并且有癌变的可能，慢性缺血性结肠炎有治愈的可能。当患者出现腹泻时，可以在医生的指导下口服蒙脱石散，出现腹胀时可以口服多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等，出现肠痉挛是可以口服消旋山莨菪碱片、硫酸阿托品片等，患有炎症性肠病者可以口服柳氮磺吡啶片、美沙拉嗪肠溶片等，慢性缺血性结肠炎患者应停止服用收缩血管的药物，可以进行补液、扩血管治疗，如果合并肠梗阻、肠穿孔等，需进行手术治疗。