咽峡炎可能是细菌感染引起的，如链球菌感染、肺炎双球菌感染等，也有可能是病毒感染导致，其中以柯萨奇病毒、腺病毒多为常见，而且可以通过飞沫进行传播。当身体过度疲劳、营养不良、压力过大，或是存在龋病、胃肠道疾病、血液病、中毒等疾病时，引起身体抵抗力下降，这也会诱发咽峡炎的发生。细菌感染者可给予青霉素或头孢类抗生素治疗，病毒感染者可口服阿昔洛韦、泛昔洛韦等抗病毒药治疗。