激光手术治近视眼后遗症中最常见的是干眼症，部分原本患有干眼症的患者也可能加重干眼症的症状。此外还有可能导致患者出现屈光回退、视力下降和夜间视力差等症状，但是一般情况下会随着时间延长逐渐恢复。极少数情况下还有可能造成患者术中感染，出现病毒性角膜炎、角膜基质炎等。因此患者在术前要做好充分的心理准备，尽可能保持心情舒畅并在术前进行充分的检查，患有圆锥角膜、青光眼和角膜过薄的患者要慎重决定是否手术。