患有丝状疣的患者，可以在医生指导下选择药物治疗、手术治疗以及物理治疗等方式。常用的治疗药物包括外用药物，有氟尿嘧啶软膏、水杨酸、咪喹莫特乳膏等，皮损内注射药物有平阳霉素等，另外还有干扰素、左旋咪唑等药物。皮损较大的患者可以选择手术切除，但要注意可能留下瘢痕。冷冻、激光、电凝等物理方式适合皮损较小的患者。丝状疣通常在一年内可自行消退，无伴随症状的患者可以不处理。