孩子高烧39度可以进行下列处理：1.物理降温，例如温水擦浴、冷敷或是使用退热贴等物理方法进行治疗。通过这些物理方法可以促进炎症消散，有缓解不适症状。2.药物治疗，若是物理治疗无效，考虑是由于感染或是疾病导致的高烧，建议您去医院进行血常规和C-反应蛋白检查。如果是由于病毒感染引起的，可以使用利巴韦林进行治疗。平时要多饮水，多吃新鲜的水果和蔬菜，注意保暖。