肠内瘘患者常见症状有腹泻、体重减轻、营养不良等。若是肠外瘘，患者患者可在体表出现瘘口，通常会有食物或气体从瘘口流出，并伴有剧烈腹痛、瘘口红肿、发炎、腹胀、发热等表现。由于瘘口造成肠液流失，部分患者还会有电解质紊乱、酸碱失衡等症状，例如低钾、代谢性酸中毒、碱中毒等。另外，肠瘘引起腹腔感染，影响进食患者还会出现营养不良的问题。若瘘口治疗不及时继发脓毒性休克，可危及患者生命。