母乳喂养和人工喂养的主要区别在于孩子的胃肠道反应以及免疫力强弱。母乳是最合适新生儿的食物，其中的各种营养配比不会对孩子的胃肠道产生较多负担，配方奶粉相对比较难消化，部分胃肠道功能不佳的患儿容易出现腹泻、便秘等症状。母乳中，尤其是初乳，含有一定的免疫物质，其中含有的分泌型IGA可以有效降低呼吸道疾病的发生几率，而配方奶粉中则没有该成分，所以人工喂养的孩子抵抗力可能会低于母乳喂养的孩子。