运动后小腿疼能否继续运动要根据小腿疼的原因来决定。如果是因为长时间不运动，或者是运动量较大导致的小腿内乳酸产生过多，堆积后形成肌肉酸痛，小腿没有出现实质性的损伤，是可以在休息、局部按摩缓解后继续运动的。但如果是运动损伤，例如肌肉和韧带的撕裂或者是骨折等，是不建议继续运动的，可能会加重病情。平时运动时要注意把握运动时间和运动量，避免超出身体负荷，引起身体不适，出现明显不适要及时就医判断病因。