结肠炎患者要根据不同的的疾病类型选择不同的药物进行治疗，如果是炎症性结肠炎，可以使用氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂以及生物制剂来治疗。如果是缺血性结肠炎，可以停用具有缩血管作用的药物，进行补液、扩血管和改善微循环来治疗，必要时加用抗生素。感染性结肠炎可以使用抗生素治疗。放射性结肠炎可以使用抗炎药物、类固醇激素、硫糖铝或是短链脂肪酸等药物治疗。