胎儿磁共振检查主要用于排除胎儿发育畸形，比如脊柱裂、无脑儿、唇腭裂、颅内占位性病变、肝脏血管瘤、脑部积水、侧脑室增宽、先天性心脏病、肢体短缺以及肺部发育不良等，其可以用于了解B超检查不能看到的胎儿异常表现。胎儿磁共振检查不属于孕期常规检查，如果唐氏筛查、四维彩超检查都是正常的，则不需要进行胎儿磁共振检查，怀孕前三个月也不建议进行此项检查。