肠胃炎腹泻时的治疗有卧床休息，少食多餐，多吃点高热量、高维生素的食物，腹痛严重的患者需使用解痉止痛的药物，比如阿托品等；同时使用止泻药物，用来保护肠粘膜，比如蒙脱石散、果胶等；腹泻时间较长者，还要使用双歧杆菌来调节肠道菌群；腹痛时可以使用胃黏膜保护剂和抗酸剂，来缓解胃部刺激引起的疼痛。经过治疗后，大部分患者预后较好，三个月后来医院复诊。