怀孕40天若是不想继续妊娠，可以选择药物流产或是人工流产的方式。做流产前必须要做腹部超声检查，确定宫内妊娠的情况。两种流产方式各有利弊，用药物流产的好处就是对身体的损伤比较小，没有器械刮宫，一般不会对子宫内膜造成严重的损伤；而人工流产会存在刮宫，容易损伤子宫内膜。人工流产的优点是速度快、时间短，当天可以出院；而药物流产要服药3天才能流产，且药物流产流血时间较长，还会有流产不全的问题。