尖锐湿疣目前临床上用来治疗的药物有3.75%或5%的咪喹莫特乳膏、0.15%或0.5%鬼臼毒素乳膏、30%到50%三氯醋酸溶液、干扰素。鬼臼毒素乳膏适用于数量少、疣体小的尖锐湿疣，使用前先用油质抗菌药膏保护皮损周围的正常皮肤或黏膜，再用鬼臼毒素乳膏。咪喹莫特乳膏是一种免疫调节剂，有产生免疫调节和抗病毒作用。干扰素局部外用对小的尖锐湿疣有一定效果。三氯醋酸溶液可以将疣体腐蚀脱落。