宝宝发烧肚子疼可以进行下列处理：1.若是不伴有其他不适症状，可以给宝宝进行物理降温。如果体温过高可以使用布洛芬进行治疗。2.若是宝宝还伴有上腹疼痛和恶心、呕吐的情况，考虑是阑尾炎，可以使用阿奇霉素进行治疗，如果症状严重需要进行手术治疗。3.若是宝宝伴有腹泻的情况，建议去医院进行粪便培养检查，若是由于急性肠胃炎引起的，可以使用双歧杆菌进行治疗。平时要合理饮食，注意保暖。