一、两种药物的结构不同：氨溴索属于溴己新的衍生物。二、两种药物的作用机制不同：溴己新主要是通过抑制酸性蛋白等功效，来起到祛痰的作用，而氨溴索主要是通过促进肺表面活性物质分泌等来起到祛痰功效。三、功效不同：两种药物都有祛痰功效，但氨溴索还可以起到保护呼吸道黏膜、润肺等功效。患者在用药治疗的同时也要多喝水，要注意保持室内通风，避免处于粉尘、油烟环境下。