卵巢囊肿的生理性和病理性，有以下方面的区别。1.生理性的卵巢囊肿可在几个月内自行消失，无症状者定期监测即可。病理性的卵巢囊肿无法自愈，随着病情的发展还可能会发生恶变，需要去医院，选择合适的方式进行治疗。2.生理性卵巢囊肿发病原因和内分泌或激素水平有关。病理性卵巢囊肿是因为局部病变导致。3.生理性卵巢囊肿是良性囊肿，而病理性卵巢囊肿可能属于恶性囊肿。