进行肛门指检一般是不会觉得痛，相较肛门镜检查来说不适感更少。在进行肛门指检时医生需要戴上手套，在手指上涂抹润滑油去进行肛门的探查，通过触摸的方式去明确肛门的6cm以内的黏膜内是否有肿块、结节或是触痛存在，还要观察指套上是否有血液。而肛门镜是对整个直肠黏膜去进行检查，明确黏膜是否有病变的情况，这项检查可以在麻醉下进行，不会造成患者有不适感。