甲胎蛋白高考虑是发生肝癌等肿瘤疾病引起的，或是病毒性肝炎、肝硬化等疾病导致的，若甲胎蛋白浓度高于400ng/L，就高度怀疑是发生了肝癌。女性怀孕后也会出现甲胎蛋白一时性增高的表现，这种情况是正常的，可不做特殊处理，一般在产后三周后会逐渐恢复正常。甲胎蛋白高还有可能是胎儿畸形发育导致的，如无脑儿、脊椎裂等。另外，共济失调、毛细血管扩张症、先天性酪氨酸病、恶性畸胎瘤、卵巢瘤等疾病也常有甲胎蛋白增高的表现。