溃疡性结肠炎的病因目前不是很明确，主要是和环境、遗传、免疫和肠道微生物等因素有关系。比如父母患有溃疡性结肠炎，那患者发生溃疡性结肠炎的发病率会偏高；或者患有类风湿性脊柱炎等免疫疾病，导致肠道粘膜免疫系统失衡，导致溃疡性结肠炎的发生，免疫因素在溃疡性结肠炎发病中起重要作用；如果吃些不干净的食物，肠道受到感染，也会增加患病风险。