新生儿房缺3mm的自愈率是多少，还要根据具体情况进行具体分析。临床上有数据表明，继发孔房间隔缺损自愈率整体上能够达到百分之八十七，小于三毫米以下的房间隔缺损，并且是在宝宝三个月以内诊断，一般在一岁半内自然闭合率能够达到百分之百，缺损在三至八毫米的房间隔缺损。在一岁半以内，自然闭合率能够达到百分之八十以上。而缺损在八毫米以上的房间隔缺损则很少有自然闭合者。