人流手术不干净的处理，根据复查彩超的结果，分为以下几种：1.如果宫内残留物比较少，可在医生指导下通过药物治疗，一个星期后再次复查彩超，观察结果。2.如果宫内残留物比较多，且流产术后时间不久，可以再次进行清宫，因为此时若不清宫，可能会引起大出血或引发感染。3.如果宫内残留物比较多，且流产术后时间过久，此时清宫已经不能彻底的将残留物清除干净了，需要在宫腔镜下进行手术清除。